了解我国不同来源非O157产志贺毒素大肠埃希菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli, STEC)分离株携带的eae基因型别。
方法PCR扩增eae全长基因，扩增产物经测序并拼接后在美国国立生物技术信息中心(NCBI)中进行BLASTn比对，判定其eae基因型别，并与GenBank中已公布的30种eae不同型别的序列及产志贺毒素大肠埃希菌主要流行血清型(O157∶H7, O26∶H11, O103∶H2, O111∶H8, O145∶H28, O45∶H2, O121∶H19)代表性基因组测序菌株的eae序列用Neighbor-Joining法构建系统发生树，分析其进化关系。根据mlst.ucc.ie数据库提供的大肠埃希菌多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)方案对菌株进行MLST分型分析，确定菌株等位基因型及序列类型，并用BioNumerics软件构建最小生成树(minimum spanning tree, MST)，分析携带eae基因的非O157 STEC分离株与溶血性尿毒综合征相关大肠埃希菌(HUS-associated enterohemorrhagic E．coli，HUSEC)、E.coli MLST数据库中所有人源流行血清群O26、O103、O111、O121、O145、O157 STEC菌株的进化关系。
结果10株不同来源的非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株经扩增拼接后均获得了约2.8 kb的eae基因全长序列，分为3种已知的eae基因型别，其中以β1型为主(6/10)，2株θ型，2株γ1型。某些eae序列与主要流行血清型STEC的eae序列完全一致。10株菌分为7个ST型，与HUSEC、人源流行血清群STEC菌株具有相近的进化关系。
结论我国非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株eae基因存在一定程度的多样性，eae阳性菌株具有潜在的高致病性。