构巢曲霉菌基因组中的数量可变重复序列的组成和分布

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利用已经公布的构巢曲霉菌基因组测序结果,对该真菌已测序基因组(30.1 Mb)中的数量可变重复(VNTR)序列进行了较为系统、全面地分析.结果表明,在已经公布的基因组序列中,共有4 837个以1~6个核苷酸为基序的VNTR序列(长度大于15 bp,匹配值大于80%),其碱基总数占整个基因组碱基数的0.31%,平均6.2 kb碱基中分布有一个大于15 bp的VNTR.其中数量最多的五碱基VNTR,数量达到1 386个,其次为六碱基VNTR (1 228个),三碱基VNTR(1 199个),这3种VNTR总数
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