雌激素β受体喹啉类配体的分子对接及3D-QSAR研究

来源 :化学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mhj911
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
对33个喹啉衍生物的雌激素β受体活性进行了分子对接以及比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA).研究发现对接得分与亲合活性pIC_50具有显著的线性相关关系.进一步分析表明:色烷环与喹啉环上的羟基与受体间的氢键作用,样本与受体口袋的疏水作用,以及样本与受体Arg346和Giu305残基间的静电作用是影响亲合活性的主要因素.此外,样本喹啉环上取代基的空间位阻作用亦对活性有重要影响.根据对接后的优势构豸将33个样本进行叠合并进行CoMFA与CoMSlA研究,其中以选用立体场、静电场、疏水场和氢键供体场建立自CoMSIA模型结果最优,其主成分,r~2,q~2(LOO)和r_pred~2分别为6,0.958,0.669和0.741.三维等势图分析结果与对接分析结果基本一致.“,”The molecular docking followed by comparative molecular field analysis (CoMFA) and com-parative molecular similarity index analysis (CoMSIA) was employed to the three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) studies of estrogen receptor-β of 33 quinoline derivatives. A sig-nificant correlation coefficient was obtained between total scores and binding affinities. The results showed that the hydrogen-bonding interactions between the hydroxy group of chromane and quinoline ring and the receptor, hydrophobic interactions between the ligand and the active site of estrogen receptor-β, and elec-tronic interactions between the ligand and the Arg346 and Glu305 residuals were the dominant factors af-fecting the binding affinities. Besides, the steric effect of substituting group of quinoline ring also affected the binding activities. Based on the docking conformations, CoMFA and CoMSIA were employed to the QSAR studies of 33 quinoline derivatives. The number of principal components, r~2, q~2 (leave-one-out, LOO), r_pred~2 of the optimal CoMSIA model were 6, 0.958, 0.669 and 0.741 respectively. The conclusions obtained from contour map analysis were in agreement with the docking results.
其他文献
随着素质教育深入实施,要想充分发挥学生在初中英语教学课堂中的主体作用,重在解放学生,尊重学生,把握规律,同时要通过教师民主施教和精讲精练的教学形式,把课堂交给学生,让
随着2011新课标的提出,教育界掀起了一股深入学习的热浪。通过小学语文一节口语交际课的教学,对口语交际教学所涉及的诸元素进行剖析,在此基础上有针对性地提出一些解决策略,
目的:探讨以急腹症为首发症状的结肠癌临床诊治经验.方法:选取2012年1月到2014年12月于我院就诊以急腹症为首发症状的高度疑似结肠癌患者共42例为研究对象,根据患者检查结果,
目的:对鼻中隔偏曲患者精神心理特征展开初步分析,为临床工作提供有价值参考.方法:选择2015年1月—2016年12月间,我院收治的鼻中隔偏曲患者56例作为研究对象,定义为观察组,另
目的:探讨系统家庭康复训练对髋关节置换术后患者功能恢复的影响.方法:对30例患者随机分为两组,康复组对患者进行系统家庭康复训练,对照组只进行出院前康复指导及定期电话随
审美教育是实现人才素质教育目标的一个重要途径.语文课是一门综合自然美、人文美和艺术美的课程,它对培养学生感知、鉴赏艺术美和现实美,树立正确的人生观、价值观并学会创
目的:主要探讨前列地尔静脉给药所致静脉炎的主要影响因素及临床护理策略.方法:选择需要应用前列地尔注射液的患者60例,随机分为观察组30例、对照组30例,分别观察静脉给药所
在课堂教学中有效地提问不仅是教师教学的基本技能,更是实现师生互动的重要途径.针对教师在课堂提问中存在的问题,从问题设计、提问方式、评价策略三个方面优化课堂提问策略,
雌性哺乳动物生殖周期中,生殖器官发生明显的周期性变化。细胞凋亡在这种周期性变化中发挥着重要的作用。本文采用DAPI原位荧光标记技术和免疫组织化学技术,对高繁殖力品种小
屡配不孕症是奶牛四大疾病之一,经济损失严重。我们以前研制了两种治疗奶牛不孕症的药物--复方聚维酮碘凝胶和聚维酮碘泡腾片,并申请了国家专利。然而,以前研究成功的复方聚维酮