珠海市2011—2016年诺如病毒胃肠炎暴发疫情的分子流行病学研究

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:z492141756
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目的

了解珠海市2011—2016年间导致胃肠炎暴发疫情的诺如病毒病原学特征。

方法

收集2011—2016年间珠海市56起诺如病毒感染导致的胃肠炎暴发疫情病例肛拭子标本576份,应用实时荧光定量RT-PCR技术,检测诺如病毒GⅠ群、GⅡ群核酸,在每起疫情中随机选取3~4份诺如病毒阳性标本,应用RT-PCR技术扩增主要衣壳蛋白VP1区基因片段并测序分型,每起疫情选取1株进行种系进化分析。

结果

56起胃肠炎疫情中,出现8个基因型,都是GⅡ群。GⅡ.4/2006b于2011—2012年流行季流行后,被其变异株GⅡ.4/Sydney_2012取代,该变异株主导2012—2013流行季,于2013年2月GⅡ.4及其变异株均消失。2014—2015流行季所发生的12起都是GⅡ.17;2015_2016流行季共发生7起都是GⅡ.3;2016年6月到9月分别是GⅡ.17和GⅡ.3;2016年11月—12月12起全部是GⅡ.p16-GⅡ.2。2011—2016年间未发现由GⅠ群病毒引发的疫情。

结论

引起本地暴发疫情的诺如病毒均为GⅡ群,多个基因型别更替流行。2016年底重组株GⅡ.p16-GⅡ.2出现并引起多起疫情,提示今后监测中应密切关注该重组诺如病毒的流行和进化。

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