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港口企业是否能同时实现环境保护与高效运作一直是政府和企业本身关心的问题。针对该问题,文章在传统DEA模型的基础上提出了基于非期望产出偏好的改进模型。该模型将环境污染物作为非期望产出,并对不同类型的产出的权重加以约束以反映对控制非期望产出的重视程度。最后,以中国上市港口企业为例,应用本文提出的模型客观地评价港口企业的环境效率,验证了改进模型的有效性。