基于全基因组测序解析不同瑞士乳杆菌菌株的遗传差异——以瑞士乳杆菌H9和H10为例

来源 :中国食品学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fujilee
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:瑞士乳杆菌是广泛用于干酪、发酵乳饮料等领域的重要发酵剂菌种之一.以瑞士乳杆菌H9和H10为例,解析不同瑞士乳杆菌菌株间的遗传背景和基因组差异,为菌株鉴定和开发应用奠定遗传学基础.方法:以瑞士乳杆菌H9和H10为例,结合NCBI数据库中其它16株瑞士乳杆菌全基因组完成图,通过比较基因组学方法探究不同菌株之间的遗传差异.结果:不同瑞士乳杆菌菌株基因组大小、质粒数量、CDSs、tRNA、rRNA数量均存在差异.系统发育分析结果显示,瑞士乳杆菌H9和H10聚类于不同进化分支.与瑞士乳杆菌H10相比,瑞士乳杆菌H9与工业发酵剂菌株瑞士乳杆菌CNRZ32的系统发育关系更近;平均核苷酸一致性(Average nucleotide identity,ANI)聚类结果与系统发育树基本一致,瑞士乳杆菌H9与H10聚类于不同类群,瑞士乳杆菌发酵乳制品分离株间的基因组序列一致性低于人类肠道/粪便分离株;与参考菌株瑞士乳杆菌DPC4571相比,瑞士乳杆菌H9和H10基因组序列中均有不同程度的片段插入、缺失和倒置;瑞士乳杆菌H9和H10特有功能基因存在差异,瑞士乳杆菌H10的特有功能基因更多涉及氨基酸和能量代谢.结论:通过比较基因组学方法分析瑞士乳杆菌基因组信息,发现不同瑞士乳杆菌菌株间存在遗传差异.
其他文献
为探究不同茶多酚添加量对冻融羊肉糜乳化及凝胶性能的影响,将经过0,1,3,5,7,9次冻融的羊肉糜作为研究对象,加入不同质量分数的茶多酚(0.00%,0.01%,0.10%,0.30%)后,测定其表面疏水性、蛋白质溶解度、乳化稳定性、保水性、质构特性、凝胶强度和微观结构.结果表明:添加适量茶多酚(0.01%)可显著改善羊肉糜的乳化稳定性、保水性、质构特性(P<0.05),扫描电镜结果显示其凝胶结构分布致密且细腻;而过量添加茶多酚会破坏羊肉糜的乳化及凝胶特性,导致羊肉糜表面疏水性、乳化稳定性及凝胶强度显著下
为实现马面鱼皮的高值化利用,优化其胶原蛋白制备ACE抑制肽的酶解条件,通过超滤、凝胶色谱、高效液相及U-PLC-MS等方法分离、纯化及分析ACE抑制肽.探讨pH值、温度及体外模拟胃肠消化对分离制备多肽的ACE抑制活性的影响.结果表明:利用复合酶解法可制备高活性ACE抑制肽,即在蛋白酶N“天野”2G用量1200 U/g,胰蛋白酶用量2400 U/g,底物质量分数4%,温度40℃,pH 8的条件下酶解4 h,酶解产物ACE抑制率达74.3%.经超滤、凝胶分离制备3个高活性级分(a1,a2,a3),稳定性研究表
目的:研究不同年份标准仓储广陈皮表面微生物的分布特点.方法:采用高通量测序的方法对贮存年限为0,1,2,3,4,5,10,15,30年的广陈皮进行测序,结合OUT分析、Alpha多样性分析与主成分分析方法,分析广陈皮表面真菌与细菌在“属”水平的分布特点.结果:9个贮存年限的广陈皮样品中真菌的物种类型丰富程度总体为先上升后下降,在贮存年限为2,3,4,5,10年时,物种类型数目较多且均一性好.前10年的优势菌属主要为青霉菌属与曲霉属,而后是耐干霉菌属.有别于真菌,细菌种类数目的变化波动较大,但每种细菌的丰度
目的:从土壤中筛选产抗真菌肽的菌株,并通过优化其发酵条件提高产量.方法:用琼脂扩散法筛选菌株;通过形态观察、理化测定和16S rDNA序列分析鉴定菌株;采用蛋白酶处理、硫酸铵沉淀、膜透析、热稳定性研究确定抑菌物质;采用单因素和正交试验优化其发酵条件,并在发酵罐中放大验证.结果:获得1株产抗真菌物质的菌株,鉴定为爱媛类芽孢杆菌,命名为爱媛类芽孢杆菌(Paenibacillus ehimensis)HD.所产抑菌物质为小分子多肽,分子质量约1 ku,其抑菌谱广,能抑制多株腐败真菌和致病细菌.爱媛类芽孢杆菌HD
建立特殊医学用途全氨基酸水解配方奶粉中牛磺酸新的衍生方法,结合二维液相色谱体系精确定量.奶粉基质经超纯水溶解,亚铁氰化钾和乙酸锌沉淀蛋白,用高质量浓度30 mg/mL丹磺酰氯衍生,有机碱三乙胺调节衍生环境,60℃水浴加热1 h.衍生液在Agilent XDB-C18色谱柱上,以甲醇和0.1%三氟乙酸为一维流动相分离其余氨基酸,锁定牛磺酸的出峰时间,通过柱切换技术,经捕集和中心切割后,被切换进入Thermal AccucoreTM PFP色谱柱,以乙腈和0.1%甲酸为二维流动相进行梯度洗脱,用荧光检测器进行
本文合成并表征P2Mo17Ni、P2Mo17Cr、P2Mo17Co和P2Mo184种Dawson型多金属氧酸盐,通过循环伏安法研究不同多酸浓度和不同扫速下4种多酸水溶液的电化学性能,并在适宜条件下催化不同浓度的酪氨酸酶,研究多金属氧酸盐水溶液对酪氨酸酶的催化作用,研究果表明:4种化合物的氧化还原过程均属于扩散控制过程,对酪氨酸酶的电化学传感均显示出良好的稳定性,且响应电流与酪氨酸酶含量之间具有良好的线性关系,其中P2Mo17Ni的检测效果是4种化合物中最优的.通过计时安培曲线可知P2Mo17Ni对酪氨酸酶
以延长双孢蘑菇货架期为目标,考察不同温度(4,16,25℃)条件下,不同质量浓度(0.15和0.30 g/L)的ε-聚赖氨酸盐酸盐(ε-PL)对采后双孢蘑菇表面背景菌群及假单胞菌生长的影响,建立货架期预测模型.贮藏期间,分析感官评分、白度评价、硬度评价、失重率及水分含量等指标的变化,研究ε-PL对双孢蘑菇的保鲜性能.结果表明:4,16和25℃时,双孢蘑菇在不同质量浓度的ε-PL(0.15和0.30 g/L)作用下,背景菌群及假单胞菌的生长曲线分为3个阶段(迟缓期、对数期和稳定期).在4℃条件下,ε-PL对
金黄色葡萄球菌是危害烤鸭等熟肉制品食用安全的常见病原菌之一.本研究旨在考察不同贮藏温度条件下烤鸭中金黄色葡萄球菌的生长特性,构建并比较相关动态生长预测模型.将含有两株金黄色葡萄球菌的混合菌液接种至烤鸭样品,然后分别置于12,16,20,25,30和35℃条件下培养,测定其生长曲线.通过一步法对金黄色葡萄球菌的生长数据进行拟合分析,构建同时包含初级模型(Huang模型或Baranyi模型或Two Compartment模型)与二级模型(Huang Square Root,HSR模型)的组合生长模型.结果表明
选用鲜莲为试材,在(20±1)℃贮藏条件下,以清水浸泡(CK)作对照,研究不同浓度(0.2,0.4,0.6 mmol/L)水杨酸(SA)处理对鲜莲贮藏品质和抗氧化酶活性的影响.结果表明:与对照相比,SA处理可有效保持鲜莲的感官品质,抑制呼吸作用,延缓营养物质的下降.其中,0.4 mmol/L SA处理效果最佳,可有效延缓莲子褐变度、可溶性固形物、丙二醛含量的上升,抑制莲子还原糖、可溶性糖、淀粉和总酚含量的下降;0.4 mmol/L SA处理还维持莲子较高的超氧化物歧化酶、过氧化氢酶、过氧化物酶活性,并显著
以宁夏盐池滩羊为试验原料,采用低场-核磁共振技术研究3个温度下羊肉烤制过程中水分的分布与迁移规律.结果表明:3个烤制温度下羊肉水分含量均逐渐降低趋势,烤制20 min的羊肉含水率在55%左右.羊肉的L*值随烤制时间的延长呈先上升后下降,a*值呈先下降后趋于平衡趋势,b*值呈先上升后趋于平衡趋势.3个烤制温度下的结合水含量普遍呈现上升的趋势,而不易流动水含量呈现相反的趋势,自由水含量差异不显著(P>0.05).不同烤制时间条件下羊肉弛豫时间对应的不易流动水和自由水发生明显迁移,水分的自由度由高至低,水分流动