探讨BCR-ABL1阴性骨髓增殖性肿瘤(MPN)钙网蛋白(CALR)基因突变分类及其与临床表现的关系。
方法采用基因组DNA聚合酶链反应(PCR)扩增产物Sanger测序法检测2015年11月至2018年11月上海交通大学医学院附属瑞金医院236例BCR-ABL1阴性MPN患者(除外真性红细胞增多症及CALR突变阴性)CALR基因第9号外显子突变情况,根据PCR测序结果,分为52 bp缺失(1型)突变、5 bp插入(2型)突变及其他类型突变,比较原发性血小板增多症(ET)(198例)和原发性骨髓纤维化(PMF)(38例)患者间两种突变携带者的临床特征。对测序法无法分类的突变类型根据突变蛋白肽链α螺旋倾向分值和带负电荷氨基酸残基保留程度进行分类,比较两种分类方法的差异。
结果236例患者中,206例(87.3%)检测出CALR基因1型或2型突变,包括ET 173例(99例1型突变,74例2型突变),PMF 33例(28例1型突变,5例2型突变);30例为其他类型CALR基因突变,包括ET 25例,PMF 5例。173例CALR基因突变ET患者中,1型突变患者白细胞计数高于2型突变患者[(8.6±2.7)×109/L比(7.6±2.4)×109/L,t=2.45,P=0.015];33例CALR基因突变PMF患者中,1型突变患者年龄高于2型突变患者[(58±13)岁比(41±16)岁,t=2.51, P=0.018]。根据突变蛋白肽链α螺旋倾向分值和肽链带负电荷氨基酸残基保留程度对测序法非1型和非2型27种突变分类时,二种方法有差异。根据突变蛋白肽链α螺旋倾向分值分类时,PMF患者中1型+1型样突变比例高于其在ET患者中比例[78.9%(30/38)比56.6%(112/198),P<0.01];根据突变蛋白肽链带负电荷氨基酸残基保留程度分类,突变蛋白肽链的等电点(pI)值明显高于野生型序列,1型样突变蛋白肽链的pI值高于2型样突变(11.79±0.15比10.02±0.42, t=11.51, P<0.01)。
结论CALR基因1型突变的ET患者可能与骨髓纤维化转化的高风险密切相关。根据突变蛋白肽链α螺旋倾向分值和肽链带负电荷氨基酸残基保留程度对CALR突变分类的结果存在差异,需要对CALR突变导致MPN发病机制进一步研究,以明确突变类型与疾病预后的关系。