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利用现代计算机技术对原数据处理部分进行改造,从硬件和软件两方面着手,提出一套改造方案.设计了满足数据系统要求的计算机硬件结构,同时改进了质谱峰平滑和识别的效果.通过改进直接计算的质量标定算法实现了质谱峰质量数的准确测定.实验表明:改造后的计算机系统能很好地完成原始质谱信号的采集与分析,本方案对同类仪器改造也具有一定参考价值.