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由中共中央、国务院下发的加强农村卫生工作的决定，明确指出了新型合作医疗制度是由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度，而计算机网络建设的好坏将直接决定这一制度的成败。这一系统应以国家农村合作医疗制度为依据，同时又要结合2005年5月最新的卫生部《新型农村合作医疗信息管理系统规范》，并结合本地新型农村合作医疗特点，开发出一套适合当地实际情况的计算机网络。