基于基因组学技术探讨商陆肾毒性机制

来源 :中国药理学与毒理学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yhj740821
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目的采用基因组学方法与技术,探讨商陆肾毒性的特点及其作用机制。方法取Wistar大鼠24只,随机分为商陆高剂量组、商陆低剂量组和对照组,每组8只,分别灌胃给予20 g生药/kg、10 g生药/kg商陆水煎液和等体积蒸馏水,连续给药49 d。于50 d处理动物,取血清和肾组织。全自动生化分析仪检测血清中尿素氮(BUN)、肌酐(CR),HE染色光镜观察肾组织病理变化。同时取肾组织进行总RNA的抽提、RNA纯化及质控、样本标记、标记扩增后的cRNA及质检、芯片杂交、芯片洗涤、扫描与分析、数据筛选标准等过程,并对得到的差异基因进行功能分类和通路分析,最后对部分差异基因的RT-PCR进行验证。结果①与对照组相比,给药49 d后商陆高、低剂量组BUN和CR均出现明显升高(P<0.05);肾组织病理学均出现皮质肾小管上皮嗜碱性变、灶状,有一定的剂量依赖关系。②基因组学结果显示,总RNA质量合格,完整性好,无降解及污染现象。与对照组相比,商陆高剂量组有2560个基因发生差异表达,KEGG通路分析显示这些差异基因主要涉及的功能通路包括:信号转导通路(MAPK,VEGF,Erb B和T细胞受体等信号通路)及细胞凋亡、蛋白消化吸收、嘌呤代谢等。低剂量组中有1923个基因差异表达,KEGG通路分析显示这些差异基因主要涉及的功能通路包括:信号转导通路(MAPK,VEGF,TGF-beta,Erb B和T细胞受体等信号通路)、及蛋白消化吸收、丁酸甲酯代谢等。研究显示,IL1β,CACN,FGFR,p38,NF-κB和TGFβ1等参与了MAPK信号转导通路中的MAP,JNK和p38的三条信号通路。利用RT-PCR技术对基因芯片上发生差异表达的IL-1β,EGFR和TGFβ1基因进行验证,结果与基因芯片基本一致。结论商陆肾毒性机制可能是通过激活MAP,JNK和p38的三条信号通路,直接或间接引起炎症反应、细胞凋亡等机制。
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