【摘 要】
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文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)是中国北方重要的集药用、食用、观赏和绿化于一身的多用途经济树种.利用MISA软件从文冠果根、叶、花和果实高通量转录组库的45 335条
【机 构】
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大连民族大学,资源植物研究所,生物技术与资源利用教育部重点实验室,大连,116600
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文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)是中国北方重要的集药用、食用、观赏和绿化于一身的多用途经济树种.利用MISA软件从文冠果根、叶、花和果实高通量转录组库的45 335条Unigenes中,搜索挖掘出12 606个SSR标记.在这些SSR标记中,有34.29％的单核苷酸重复、32.82％的二核苷酸重复、29.22％的三核苷酸重复、0.69％的四核苷酸重复、1.59％的五核苷酸重复和1.39％的六核苷酸重复.Unigenes中的408条涉及调控文冠果花色、叶色、果实开裂、成熟期、心室数、种子生长发育、大小和粒重等目的性状,从这些目的基因中共搜索挖掘到64个SSR标记,以辽冠1号叶片DNA为模板从这些SSR标记中共筛选出42对具有清晰扩增条带的SSR标记.以选取的5份表型性状差异明显的文冠果种质叶片为材料,通过对初筛的42对SSR引物的多态性筛选,获得了18对文冠果多态性SSR引物.本研究利用高通量RNA-seq开发的文冠果目的基因SSR标记,可为文冠果指纹图谱构建、遗传多样性分析和标记辅助选择育种等提供分子标记,对文冠果研究和开发利用具有重要意义.
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