【摘 要】
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目的 检测分析DHRS4基因簇新命名基因DHRS4L1的RNA选择性剪接亚型和转录特点,并预测其功能.方法 cDNA末端快速扩增克隆DHRS4L1转录本剪接亚型的全长序列,Jellyfish软件比对RN
【机 构】
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汕头大学医学院组织胚胎学教研室,汕头大学医学院细胞生物学教研室
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目的 检测分析DHRS4基因簇新命名基因DHRS4L1的RNA选择性剪接亚型和转录特点,并预测其功能.方法 cDNA末端快速扩增克隆DHRS4L1转录本剪接亚型的全长序列,Jellyfish软件比对RNA亚型的外显子组成,RNAStructure和在线开放读码框预测其二级结构和蛋白编码功能,定量PCR检测DHRs4L1剪接亚型在不同细胞系中的表达水平.结果 在人神经母细胞瘤细胞克隆得到3个DHRS4L1 RNA剪接亚型的全长序列,它们具有相对稳定的二级结构,开放读码框短并且缺乏真核生物的翻译起始位点.定量PCR检测显示DHRS4L1在肝细胞表达高,在神经母细胞瘤和睾丸细胞中表达较低.结论 DHRS4L1转录产物存在不同长度的剪接亚型,它们可能不是蛋白的编码序列,而是作为非编码RNA参与其它基因的表达调控.
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