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从国际视角，实证考察了2001—2011年间我国科学创新投入产出状况。研究发现，在影响国家科学创新能力提升的因素中，RN-D经费投入强度落后于经济社会发展阶段是关键制约因素；政府对高校R＆D经费投入比例偏低和基础研究资助对象不明确，是导致基础研究投入长期以来不断走低的重要原因。因此，为了使国家科学创新能力有一个质的提升，政府必须在不断提高R＆D经费投入强度的前提下，从根本上改革目前落后的资源配置结构。