目的分析云南省保山市疟疾发病在时间上的阶段性变化特征,为开展消除疟疾及消除后的监测提供参考。方法通过文献检索,收集云南省保山市1951-2016年疟疾年发病例数及发病率数据。建立以干预措施及时间为影响变量的时间序列结构性模型,分析不同参数条件下疟疾发病率时间序列的结构特征。利用当地预防和控制措施的实施作为趋势变量,结合时间序列结构方法,分析66年来收集的疟疾数据变化的多个结构阶段。结果保山市疟疾疫情在时间上的变化是不平稳的,单位根检验拒绝平稳性零假设(P=0.0003<0.05)。保山市疟疾疫情在历史上曾出现7个阶段性的变化,以干预措施为回归变量的时间序列结构性模型较好地拟合了云南保山疟疾发病率在时间上的变化,分别为1951-1952年、1952-1959年、1959-1968年、1968-1975年、1975-1986年、1986-2009年及2009-2016年。从结构模型来看,有三个上升期:1951-1952年、1975-1986年和1986-2009年,但整体发病率呈下降趋势。结论采用干预措施为回归变量的时间序列结构性模型较好地拟合了云南保山疟疾发病率在时间上的变化规律,预测效果好,可为进一步制定预防输入和再传播措施提供参考。