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如何提高企业、科研机构、高等院校合作创新效率 ,越来越受到关注。通过对合作创新中两类问题即降低交易成本和有效传递知识的分析 ,发现降低交易成本的努力有时却阻碍了合作过程中知识的有效传递。如果不能尽快解决制度创新中存在的问题 ,在合作创新中必然会不断引发这种知识传递与制度创新的矛盾 ,从而影响着合作创新的效率和效果。