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为从小桐子嫩叶中提取高质量的基因组DNA,采用改良CTAB法提取的基因组DNA通过OD260/OD280比值测定,琼脂糖凝胶电泳和ISSR-PCR扩增检测,结果表明改良CTAB法提取的DNA纯度高,可作为ISSR分子标记的模板。同时,采用正交设计的方法,对影响小桐子ISSR-PCR反应体系中的4个因素（引物、Taq DNA Polymerase、10×Buffer（含Mg2＋）、dNTPs）在3个水平上进行优化试验。建立了适合小桐子的既稳定又能扩出最多数量谱带的ISSR最优反应体系,即20μl的