《国家基本药物目录管理办法（暂行）》第十二条指出国家基本药物目录遴选调整应当坚持科学、公正、公开、透明。建立健全循证医学、药物经济学评价标准和工作机制，科学合理地制定目录。广泛听取社会各界的意见和建议，接受社会监督。但根据目前我国基本药物2009版、2012版目录遴选情况来看，遴选程序的透明度尚未从根本上得到提高和保证，除有关专家外，其他利益相关者对目录遴选的进展情况知之甚少，参与度极低。不言而喻，遴选程序透明度越低，程序公平越难以保障，遴选的公正性也会随之降低。本文将从基本药物制度本身的法学性质进行探讨，通过对基本药物遴选的程序要素的分析，说明遴选程序公平的必要性。