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采用正交设计L16（45）对辣椒ISSR-PCR反应体系的5个因素（Taq酶、Mg2＋、模板DNA、dNTPs、引物浓度）在4水平上进行优化试验。结果表明,最佳反应体系为：在25μl总反应体系中,含1×PCR缓冲液、2.0 mmol Mg2＋、1.5 unitTaqDNA聚合酶、0.25 mmoldNTP、0.48μmol引物、120 ng模扳DNA。扩增程序为：95℃预变性5 min;94℃变性45 s,51℃退火1 min,72℃延伸2min,进行38个循环;最后72℃延伸10 min。新优