基于生物信息学探讨骨关节炎患者LncRNA表达及CeRNA互作网络

来源 :中国老年学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：flyliubo

【摘要】

：

目的基于生物信息学初步探讨骨关节炎(OA)的差异表达基因。方法检索GEO数据库中与OA相关的芯片,借助R语言分析差异基因,并通过公共数据库来构建竞争性内源RNA(CeRNA)网络。随后采用String数据库和cytoscape软件筛选关键(Hub)基因,分析其与核心长链非编码RNA(LncRNA)的相关性。最后利用DAVID数据库对靶基因进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果①与正常关节组织相比,OA患者共有3292个mRNA、67个LncRNA存在明显差异表达

【作者】

：

陈锋章晓云陈跃平廖建钊周毅李嘉骏吴炜锋

【机构】

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广西中医药大学附属瑞康医院,江西中医药大学

【出处】

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中国老年学杂志

【发表日期】

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2021年16期

【关键词】

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骨关节炎生物信息学长链非编码RNA 竞争性内源RNA R语言

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81760796,81960803),广西自然科学基金青年基金(2020GXNSFBA159053),广西大学生创新创业计划项目(202010600025),广西高校青年教师基础能力提升项目(2019KY0352),广西中医药大学2019年校级科研课题(2019QN027),广西中医药大学一流学科课题(2019XK029)。

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