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目的
建立一种新型分子探针设计方法,用于提高microRNA检测灵敏度和特异性。
方法实验研究。利用链置换原理将靶标杂交序列部分设计在分子信标茎端,在此基础上再利用核酸结构分析软件DNAman优化分子探针的二级结构设计出新的探针,分别称为链置换优化探针(MB-D)和链置换二级结构优化探针(MB-D plus),将MB-D和MB-D plus与传统分子信标(MB-C)对比检测microRNA-21及其单碱基突变体,分析不同探针对于microRNA检测的最低检出限、重复性和特异性等。
结果MB-C对microRNA-21的最低检出限为1 nmol/L,MB-D和MB-D plus的最低检出限分别为0.1 nmol/L和0.01 nmol/L;所建立的MB-D plus探针可以显著区分miR-21与单核苷酸突变靶标。
结论基于链置换原理并通过二级结构优化的分子探针可显著提高探针对于microRNA检测的灵敏度和特异性。(中华检验医学杂志,2018, 41:541-546)