螭霖鱼肠道微生物多样性分析

来源 :水产养殖 | 被引量 : 0次 | 上传用户：frjzj

【摘要】

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分析螭霖鱼肠道微生物的群落结构组成及多样性差异,研究其与其肠道内共生微生物的协同进化关系。提取螭霖鱼的肠道内容物及粪便微生物DNA样本,利用高通量测序技术进行16S V4

【作者】

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李慧李宇飞孟子育郁家宝赵永正夏倩倩孟超田园

【机构】

：

山东第一医科大学（山东省医学科学院）生命科学学院

【出处】

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水产养殖

【发表日期】

：

2020年8期

【关键词】

：

螭霖鱼测序 16S rRNA Varicorhinus macrolepisSequencing16S rRNA

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(21602152),山东省自然科学基金项目(ZR2016BB01),泰安市科技局项目(2018NS0098)

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分析螭霖鱼肠道微生物的群落结构组成及多样性差异,研究其与其肠道内共生微生物的协同进化关系。提取螭霖鱼的肠道内容物及粪便微生物DNA样本,利用高通量测序技术进行16S V4区域扩增子测序以及生物信息学分析,共得到250958条序列。基于97%的样本相似度,样本优化聚类为1200个OTU(Operational taxonomical unit),共涉及13门24纲42目56科75属。在属水平上黄杆菌属(Flavobacterium)(44.72%)、蓝黑紫色杆菌属(Janthinobacterium)(14

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