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中医高等教育体系内部存在着熵增加（即混乱度增大）的自发趋势，而这是不利于提高办学效益和教育质量的，也不利于中医教育的发展。本研究从耗散结构理论角度出发，认为优化中医高等教育管理模式的关键在于从外界获取足够的负熵流，以远离平衡态来提高中医高等教育的活力，以非线性作用作为管理工作改革的依托，以涨落触发中医高等教育教学改革，促进中医高等教育形成新的有序耗散结构。