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通过分析我国大陆区域创新能力的特点，选取创新能力测度指标，根据2005、2010年国家统计年鉴中和创新能力相关的指标数据，采用主成分和因子得分分析法，对我国2005年和2010年的区域创新能力进行对比分析研究。结果表明：我国区域创新能力由东部向中西部递减，由珠江三角洲、长江三角洲、环渤海经济圈向内陆地区辐射递减，并且我国东部发达地区和中西部欠发达地区在创新能力方面的差距在加大。