【摘 要】
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连作障碍严重影响地黄的产量和品质,对其分子机制的探寻是地黄研究领域的重要问题之一。该研究基于前期数字表达谱(DGE)分析筛选到的特异响应连作障碍转录本Unigene29334_All
【机 构】
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河南农业大学生命科学学院; 河南农业大学林学院; 福建农林大学作物科学学院;
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31271674);河南省高等学校重点科研项目(17A180024)
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连作障碍严重影响地黄的产量和品质,对其分子机制的探寻是地黄研究领域的重要问题之一。该研究基于前期数字表达谱(DGE)分析筛选到的特异响应连作障碍转录本Unigene29334_All,利用hi TAIL-PCR和RACE技术克隆到长度为1 573 bp的完整转录产物。借助ORF Finder预测发现,克隆产物所有ORF均小于300 nt,证实此转录产物为长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)。与地黄转录组数据库比对发现,此LncRNA与丙氨酸-乙醛酸转氨酶2基因(Rg AGT2)部分区域同源,因此命名为LncRNA-RgATG2。为进一步研究LncRNA-RgAGT2的功能,该研究检测了LncRNA-RgAGT2与Rg AGT2基因在头茬和连作地黄生长发育5个关键时期(苗期,拉线期,膨大前期,膨大中期,膨大后期)的表达模式,结果暗示,LncRNA-Rg AGT2可能与地黄Rg AGT2基因存在调控关系。同时,连作地黄LncRNA-RgAGT2表达水平在各个时期均发生不同程度的变化,可以作为地黄连作障碍的"诊断标签"。该研究首次证实LncRNA-RgAGT2参与地黄连作障碍应答及调控过程,是对地黄连作障碍分子机制的有力补充。
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