基于数据库挖掘:TRIM44蛋白在结直肠癌中的表达差异分析

来源 :中南医学科学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：liak19870702

【摘要】

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目的通过数据挖掘分析TRIM44在结直肠癌中的表达及意义。方法对TCGA和GEO数据库结直肠癌中TRIM44的数据进行R语言脚本分析,并通过GEPIA、TIMER等多个数据库进行了差异表达、

【作者】

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王鹏宇胡圣晨陈浙南王彦姜莹

【机构】

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牡丹江医学院,南华大学附属第一医院

【出处】

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中南医学科学杂志

【发表日期】

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2021年1期

【关键词】

：

TRIM44 结直肠癌信号通路数据挖掘巨噬细胞 TRIM44 colorectal cancer signal pathway data-mining m

【基金项目】

：

黑龙江省大学生创新创业训练计划项目(201910229070),黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划(2020-QC23),黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(2018-KYYWFMY-0035)

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目的通过数据挖掘分析TRIM44在结直肠癌中的表达及意义。方法对TCGA和GEO数据库结直肠癌中TRIM44的数据进行R语言脚本分析,并通过GEPIA、TIMER等多个数据库进行了差异表达、生存分析、肿瘤纯度与免疫浸润的关系以及相关基因的共表达和GO与KEGG分析。结果TRIM44在结肠癌中有明显的差异表达(P<0.001),TRIM44高表达者预后较差(P<0.05)。TRIM44在直肠癌中无明显差异表达。GO和KEGG分析结果显示,TRIM44共表达基因富集于调节干细胞多能性信号传导途径等

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