在西学东渐过程中，中国近代学术思想逐渐完成了从“文学的”到“科学的”的转变。科学以其“分科之学“的名义，给中国带来了现代的知识分类体系——前此本为经学之附庸的各类学科，逐渐变为独立学科。然而，在此过程中，人文学科为了反抗经学的压制，明显表现出社会科学化的取向，由此也导致中国学术研究人文传统的失落。时至今日，无论是学科的自我追求还是学科的评价机制，都已将人文学科推到“两头不靠岸”的尴尬境地——既无法达到自然学科、社会学科的严谨精密，又丧失了人文学科自我的主体性。面对人文学科边缘化、人文研究失去学科自信的现实境况，人文学者应该而且可以凭借自己的研究和思想创造力，为社会提供新的思想、理念和价值理想，以重建文化，重建价值理想。文学研究尽管可以用史学考证来丰富其研究方法，但也要恢复精神体验的诗学传统；史学不但要以史料学来夯实研究的基础，也要致力于把握中国社会过去的脉络、当前的性质和未来的走向；哲学不但要经受现代科学和逻辑的洗礼，也要致力于对时代精神框架的批判和建构。只有认识到人文学与社会科学有着不同的学科价值取向，肯定人文学“体验之知”的学科致思方式，以及它在特定空间范围内探讨人类本质和价值信仰的特质，才能确立人文学的独立性与主体性，才能站立于“学林群雄”中不为其他强势学科吞并，并形成“自是一家”的学术领域。