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传统农业生产率测度如果忽视资源环境约束，就不能准确地衡量地区农业经济的真实增长绩效。本文首先对资源环境约束与区域农业生产率之间的关系给出一个理论分析框架，在此基础上指出资源环境约束下农业生产率研究的创新方向在于：资源环境约束下的农业生产率测算比较和影响因素分析、资源环境政策实施成本分析以及资源消耗与环境污染的影子价格测算。最后结合鄱阳湖生态经济区建设的区域重大发展战略需求，阐述资源环境约束下鄱阳湖生态经济区农业生产率研究的关键问题。从而为鄱阳湖生态经济区发展现代农业产业体系提供决策支撑。