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目的比较核酸检测技术(NAT)在无偿献血不同血液安全筛查模式下阳性反应率。方法在2010年1月1日-2013年8月31日期间,采用2遍ELISA检测,无反应性样本采用Cobas Taqsceen MPX Test进行1遍NAT;2013年9月1日-2014年9月29日期间,采用1遍ELISA检测,无反应性样本采用Cobas Taqsceen MPX Test进行1遍NAT;2014年9月29日-2015年8月31日期间,采用1遍ELISA检测,无反应性样本采用Cobas Taqsceen MPX Test v2.0(MPX v2.0)进行1遍NAT。对NAT混检阳性pool采用MPX v2.0拆分单检,并鉴别病毒种类;对ELISA检测抗-HIV无反应性、HIV RNA有反应性的献血者定期进行追踪分析,观察有无血清学转换,以确定感染状态。结果3个阶段共完成NAT标本422 667份,混检阳性898pools,阳性率0.21%,其中HBVDNA混检阳性率为0.209%(893/422 667),HCVRNA混检阳性1例(1/422 667),HIVRNA混检阳性4例(4/422 667);拆分单检总阳性率为0.126%(551/422 667),拆分阳性率为61.35%(551/898),拆分后单检HBVDNA阳性545例,HCVRNA阳性2例,HIVRNA阳性4例。对HIVRNA阳性样本进行定期追踪分析,4例献血者均在献血后3个月内发生血清学阳转,确定均为窗口期感染HIV。3个阶段采用不同的检测模式,NAT总阳性反应率无显著性差异;拆分单检阳性反应率Ⅲ阶段高于Ⅰ阶段(P<0.05)。结论 NAT检测的总阳性反应率与检测模式无关;应用NAT可降低输血风险,尤其对HBV窗口期感染的阳性检出率较高。