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病原微生物可污染空气环境、土壤、水泥表面等,很多病原体可通过粪便污染而传播给猪或猪群。猪场内有很多疾病起因于受到感染的皮肤损伤,也要防范条件性致病菌导致猪群染病。注射疫苗是预防猪病的有效方式,但必须慎重使用。要了解猪群中病原体的状态,目前国际上有三种公认的描述猪群健康状态水平的术语,即无菌猪、限菌猪或既知菌的猪、无特定病原体猪（SPF）。