【摘 要】
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研究抗原与抗体的相互作用机制在治疗与抗体相关疾病药物的研发中起到重要作用．采用分子动力学模拟和MM—PBSA（molecular mechanics—Poisson Boltzmann surface area）以及溶解
【机 构】
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山东交通学院理学院,山东师范大学物理与电子科学学院
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研究抗原与抗体的相互作用机制在治疗与抗体相关疾病药物的研发中起到重要作用．采用分子动力学模拟和MM—PBSA（molecular mechanics—Poisson Boltzmann surface area）以及溶解相互作用能SIE（solvated interaction energy）方法研究了抗原Alizarin red（AZN）与抗体SPE7的结合模式．研究结果证明范德华作用主导了抗原AZN与抗体SPE7的相互作用．基于残基能量分解的计算表明抗原AZN能与残基H—W35、H—Y105、L-Y3
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