嵌合抗CD20抗体Fab‘片段三维结构的同源模建

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分别以抗CD20Fab'轻链和Fd段的氨基酸一级序列为探针,在PDB数据库中搜寻与其同源性高的蛋白作为参考蛋白,利用Insight II/MSI的同源蛋白质结构模建系统(homology) 在SGI计算机图形工作站上模建轻链和Fd段的三维空间结构后,搭建成抗CD20嵌合抗体片段F ab'的空间构象,并对模建蛋白进行分子力学和分子动力学优化.对优化后的模建蛋白的合理性验证显示,模建蛋白的三维结构是合理而可信的.
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