【摘 要】
：
目的 了解2008年广东省流行的肠道病毒(EV)71型基因特征.方法 选择2008年广东省分离的1株EV71毒株(GDFS-3),进行全基因组序列测定和基因进化特性的分析.结果 GDFS-3株与其他EV71型毒株相比,在编码区没有核苷酸的缺失和插入,其5'UTR和3'UTR的长度和序列有一定的差异.核苷酸同源性比较结果 表明,GDFS-3株与中国台湾流行株(TW984)的同源性最高(为96.0%)
【机 构】
：
510300,广州,广东省疾病预防控制中心,510300,广州,广东省疾病预防控制中心,510300,广州,广东省疾病预防控制中心,510300,广州,广东省疾病预防控制中心,510300,广州,广东
论文部分内容阅读
目的 了解2008年广东省流行的肠道病毒(EV)71型基因特征.方法 选择2008年广东省分离的1株EV71毒株(GDFS-3),进行全基因组序列测定和基因进化特性的分析.结果 GDFS-3株与其他EV71型毒株相比,在编码区没有核苷酸的缺失和插入,其5'UTR和3'UTR的长度和序列有一定的差异.核苷酸同源性比较结果 表明,GDFS-3株与中国台湾流行株(TW984)的同源性最高(为96.0%),与新加坡流行株SIN5865及标准株MS、BrCr的同源性则在81.0%左右.氨基酸同源性比较结果 表明,GDFS-3株与TW984同源件最高(99.0%).根据VP1基因序列构建亲缘性关系树,GDFS-3株与C4亚型(subgenogroup)聚为一簇,与C4亚型代表株的核苷酸序列同源性为91.0%～95.0%.结论 遗传进化分析表明,GDFS-3株和中国台湾2004年流行的EV71毒株的亲缘关系最为密切,属于C4亚型,而与标准株BrCr和MS的亲缘关系较远.5'UTR的突变对于EV71毒力增强可能有重要作用.上述结果 有助于EV71型的基础研究和中国对于EV71所致疾病的预防。
其他文献
满洲里市为鼠疫历史疫源地,建国前于1910-1921年间曾发生两次鼠疫大流行,此后,数十年间呼伦贝尔蒙古旱獭疫源地鼠疫疫情呈现一个长期的静息状态,为了解和掌握近年该疫源地鼠间疫情动态,2006-2008年连续3年进行了满洲里市鼠疫疫源地的监测,报道如下。
自然界中存在一类具有抗菌作用的多肽,称为抗菌肽(antibiotic peptide).防御素(defensin)就是其中一类,人防御素(human denfensin,HD)是一类被研究的最广泛、不含糖链的碱性阳离子多肽,其主要存在于血液、肠道及表皮细胞中,具有广谱高效的杀菌作用和独特的作用机制,不易使微生物产生抗药性。
Akt是蛋白激酶B（PKB）家族成员，是PI3K（phosphoinositide 3-kinase）下游激酶。Akt参与胞内许多重要生理过程，包括细胞周期调节、细胞存活、细胞生长、糖原代谢及细胞迁移等。Akt具有促心肌存活作用，成为目前治疗心肌缺血研究的热点。本研究首次将gfp-akt1融合基因克隆入pXZ208慢病毒载体，包装含GFP-Akt1的病毒感染心肌细胞，为揭示Akt促心肌存活的重要意
目前我国临床实验室常用的病毒运送培养基多以商业化产品为主,但其效果未见相应的实验数据.本研究利用流感病毒PR8株、呼吸道合胞病毒Long株作为试验用病毒的代表,根据临床实际应用情况对病毒运送培养基的最适条件进行筛选和评价。
为建立输液和给药通道烧伤患者经常放置静脉导管,这为细菌入侵机体提供了便利.而鲍曼不动杆菌(Acineto-bacter baumannii,Ab),尤其是多重耐药Ab日益成为医院内感染的重要病原体.我们在研究烧伤患者Ab菌的耐药机制时,发现了一株分离自静脉导管携带9种不同类型耐药基因的Ab菌。
Alloferon-1是Chemysh等于2002报道的一种由13个氨基酸组成、相对分子质量为1481.53的新型抗菌肽,动物实验证实该抗菌肽有较强的抗流感病毒和抗白血病细胞的活性.人工合成或重组表达的抗菌肽Magainin-Ⅱ的生物学活性与大然产物相同.本研究中构建了串联式表达Alloferon-1的原核重组表达系统得到rAllofemn-1-EK,同时人工合成了sAIlofemn-1和sAll
为了揭示HIV感染对人乳头瘤病毒(HPV)感染影响的情况,在深圳地区采集了一批病人标本样品,通过逆转录PCR(RT-PCR)和荧光定量PCR对80例筛选标本进行HIV感染者和非HIV感染者的HPV感染情况和病毒载量关系比较。
卡氏肺孢子菌A12抗原是近年来发现的一种相对分子质量为30×10~3的抗原蛋白.在SWISS-PROT数据库中检索其蛋白序列号为AAR20917.1.本实验通过DNAStar软件对A12蛋白的二级结构、亲水性、可及性及可塑性参数进行分析来综合性预测A12蛋白B细胞抗原表位;同时在SYFPE1THI服务器上预测A12蛋白T细胞表位。
目的 研究MHCⅡ类反式激活因子(cⅡTA)基因编码区非同义单核苷酸多态性(SNP)位点C19170G(Leu45Val)和C30799G(Ala500Gly)构成的4种不同单倍型cDNA的功能.方法 将4种不同单倍型的真核表达载体和卒载体分别转染至HeLa细胞.用RT-PCR和间接细胞免疫荧光技术检测未经转染的HeLa细胞、转染4种真核表达载体及卒载体的HeLa细胞cⅡTA mRNA与3种HLA
目的 利用多种抗戊型肝炎病毒(HEV)IgM、IgG检测试剂对戊型肝炎恢复期血清进行确认,建立戊型肝炎病毒ISG抗体的定量检测方法,初步应用于戊型肝炎疫苗接种后抗体效价检测.方法 应用多种抗-HEV IgM、IgG试剂对江苏省确诊的戊型肝炎病人发病后6个月以上的血清样品进行检测;抗-HEV IgG阳性样本应用ORF2 C端抗原和ORF3抗原Western blot进行确认,用WHO抗-HEV Ig