【摘 要】
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目的:探究5XFAD阿尔茨海默病(AD)转基因小鼠相比野生型(WT)小鼠的肠道菌群变化以及性别因素的影响.方法:采集不同性别5XFAD小鼠和WT小鼠的粪便,使用高通量测序方法对粪便基因组DNA进行16S rRNA测序.再通过nf-core和基于R语言平台的生信分析手段对测序数据进行差异分析和功能预测.结果:与WT小鼠相比,在菌群构成的门水平上,5XFAD转基因小鼠的ε-变形菌门(Epsilonbacteraeota)和变形菌门(Proteobacteria)丰富度普遍较低.在属水平上,5XFAD转基因小鼠
【机 构】
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上海绿谷制药有限公司,上海201203
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目的:探究5XFAD阿尔茨海默病(AD)转基因小鼠相比野生型(WT)小鼠的肠道菌群变化以及性别因素的影响.方法:采集不同性别5XFAD小鼠和WT小鼠的粪便,使用高通量测序方法对粪便基因组DNA进行16S rRNA测序.再通过nf-core和基于R语言平台的生信分析手段对测序数据进行差异分析和功能预测.结果:与WT小鼠相比,在菌群构成的门水平上,5XFAD转基因小鼠的ε-变形菌门(Epsilonbacteraeota)和变形菌门(Proteobacteria)丰富度普遍较低.在属水平上,5XFAD转基因小鼠的另枝菌属(Alistipes)和乳杆菌属(Lactobacillus)丰富度明显偏高,螺杆菌属(Helicobacter)的丰富度偏低.5XFAD小鼠与WT小鼠的菌群功能也存在差异.此外,菌群的结构和功能在不同性别小鼠中也显示出差异.结论:5XFAD转基因小鼠的肠道菌群与WT小鼠存在结构和功能差异,且这种差异受性别因素影响.
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