目的分析公立医院薪酬分配制度改革可能产生的问题和挑战,并探讨改革注意事项。方法查阅国家卫生部发布的《中国卫生统计年鉴》和国家统计局发布的《中国统计年鉴》,运用文献研究的方法分析2003—2010年医院的收支情况,并比较公立医院与其他单位就业人员的工资增幅。对上海市18家三级医院医务人员的工作量收集情况进行了现场调查。结果政府对公立医院的投入不足10%,明显少于人员的支出(>26%),药品收入仍超过医院收入的45%。现有薪酬分配制度能保证人员的积极性但可能导致费用快速增长;绩效工资制度的总量会有3.26%～7.38%的缺口,高收入科室人员的绩效工资比重会下降20%,从而产生激励不足;岗位工作量考核的数据不易获得,标准难以确定。结论现阶段公立医院薪酬分配挑战与机遇并存,加强政府投入的同时公立医院需强化自身管理工作,必须寻求绩效工资与现有分配制度之间的平衡,并且谨慎选择岗位工作量的计量标准与方法。