【摘 要】
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目的 运用生物信息学方法探讨酒精性肝炎(AH)发病的核心基因及其可能的靶向中药活性成分,为AH的临床治疗提供理论依据.方法 利用GEO数据库下载与AH发病相关的基因芯片数据,筛选出正常人与AH患者的差异表达基因;利用DAVID对AH患者与正常人特异性差异表达基因进行GO和KEGG分析;运用STRING数据库构建AH患者与正常人特异性差异表达基因蛋白质-蛋白质交互作用(PPI)网络;利用Cytohubba筛选AH发病的核心基因;通过比较毒物基因组学数据库筛选可能用于治疗AH的中药活性成分.结果 得到AH患者
【机 构】
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湖南中医药大学中医诊断学重点实验室,湖南长沙410208;湖南中医药大学医学院,湖南长沙410208;湖南中医药大学中医学院,湖南长沙410208;湖南中医药大学中医诊断学重点实验室,湖南长沙4102
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目的 运用生物信息学方法探讨酒精性肝炎(AH)发病的核心基因及其可能的靶向中药活性成分,为AH的临床治疗提供理论依据.方法 利用GEO数据库下载与AH发病相关的基因芯片数据,筛选出正常人与AH患者的差异表达基因;利用DAVID对AH患者与正常人特异性差异表达基因进行GO和KEGG分析;运用STRING数据库构建AH患者与正常人特异性差异表达基因蛋白质-蛋白质交互作用(PPI)网络;利用Cytohubba筛选AH发病的核心基因;通过比较毒物基因组学数据库筛选可能用于治疗AH的中药活性成分.结果 得到AH患者与正常人特异性差异表达基因631个,其中上调基因300个(47.54％)、下调基因331个(52.46％).这些基因主要涉及细胞黏附、细胞外基质组织、对药物的反应等生物过程,主要位于细胞外泌体、细胞外基质、细胞外空间等,分子功能主要包括肝素结合、结合细胞外基质、钙离子结合等.这些特异性差异表达基因主要与PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路、p53信号通路等密切相关.进一步研究获得CXCL8、ESR1、FOS等10个与AH发病密切相关的核心基因.基于核心基因检索到白藜芦醇、槲皮素、辣椒素、姜黄素、大黄素等50个可能用于治疗AH的中药活性成分.结论 从生物信息学角度探讨了AH的发病机制及其可能涉及的核心基因,并筛选出可能用于治疗AH的中药活性成分,可为AH的基础实验及临床研究提供一定的科学依据.
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