大豆Glyma08g02580及其同源蛋白的生物信息学分析

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WRKY蛋白是一个植物特有的转录因子,最古老的WRKY转录因子具有2个高度保守的WRKY结构域,大概起源于15亿~20亿年前的真核生物。虽然所有的WRKY蛋白质主要通过特异地结合靶基因启动子区域的W盒序列而调控其表达,但各家族成员的生物学功能存在着各自的特异性。通过生物信息学方法,结合大豆基因组数据库、高等植物基因组注释数据库和NCBI等相关数据库,识别、筛选并获得了大豆WRKY基因家族的蛋白序列,以实验室前期克隆得到大豆基因Glyma08g02580.1为目的基因,分析其在拟南芥、水稻等高等植物中的同源蛋白,并对其进行了系统进化分析;同时利用GEO的芯片数据对大豆在碱胁迫下的根和叶基因表达谱进行了分析,通过相关分析,获得了大豆基因组中全部的WRKY蛋白及对应的分类结果,由表达谱分析结果进一步证明了WRKY基因表达的组织特异性。
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