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针对三维场景下空间数据分布不均匀呈现区域密集的问题,本文提出并建立了三维网格-R树混合索引结构,在此基础上给出详细的维护与查询算法。该混合索引结构综合了网格快速划分三维空间以及R树高效查询的优点,较好地解决了海量非均匀分布的三维数据的快速管理、查询问题。最后针对上述混合索引结构模型构建了实验系统,对不同大小、不同分布下的数据集进行范围查询、k近邻查询对比测试,实验结果均表明了该混合索引结构在查询方面的良好性能。