严格依照刑事诉讼法关于管辖的规定，追究食药类犯罪，是正当法律程序的体现。根据实际情况看，由行政机关移送公安机关的案件，一般都是在犯罪行为发生地；而由受害人举报的案件，大都是在犯罪结果发生地。利用互联网销售假冒、伪劣商品等犯罪案件，实施网络犯罪行为的计算机终端所在地可以视为犯罪行为地，受害者所在地为犯罪结果发生地。
　　在司法实践中，食药类犯罪案件往往会涉及很多犯罪地，这些犯罪地会涉及一个省的多地，有时会涉及多省多地。根据食药类犯罪的特点，主要犯罪地应当是指生产地和销售地，在难以区分生产地和销售地哪个是主要犯罪地的情况下，如果案件有被害人的话，应当以多数被害人所在地为主要犯罪地。有管轄权的公安机关不能通过协商解决管辖争议问题，就应当由共同的上级公安机关指定立案管辖。
　　这样确定管辖，有利于案件侦破和证据搜集，会对办案机关有一定的压力而使其全力进行侦查，而上级公安机关对跨区域食药案件的指挥和协调工作，则是顺利完成侦查的必要保障。同时，尽量避免由犯罪嫌疑人居住地的公安机关进行立案侦查，主要是为了防止犯罪嫌疑人与居住地相关机构的人员，存在某种利害关系而影响或者干扰对犯罪行为的侦查。