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根据复杂体系的概念及其所呈现出的多种特性，利用复杂体系的使命分解和复杂体系的元素组成对复杂体系进行综合的结构分析，描述了目标分解、功能分解和行为分解的复杂体系使命目标三阶段分解过程以及系统单元、复合元和体系外部环境的复杂体系三元素结构框架。在此基础上，提出了采用一种“两层四级”的设计思想对复杂体系进行有效的结构建模设计，并针对复杂体系内部的相互位置层次及其功能关联定义了度量实体、层级映射、系统关联性和软构层等相关概念，清晰地阐释了复杂体系结构分析和建模时体系层次映射的实质，从而为复杂体系的效能评估以及体系