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用50对小麦SSR引物对13种黑麦基因组DNA进行扩增,只有Xgwm232,Xgwm260,Xgwm644这3对小麦SSR引物能扩增出黑麦特异的片段.这些黑麦特异片段主要集中在500bp,600bp,800bp和1000bp左右,并包含了启动子区域.然而这3对SSR引物都不能从所有13种黑麦中扩增出黑麦特异条带.这一结果表明尽管利用小麦微卫星引物能够开发黑麦特异DNA标记,但这类标记不是对所有黑麦都适用.利用某一物种的微卫星引物开发其近缘种属的特异DNA标记虽然可行,但不一定具有通用性.