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对星载扩频应答机抗单粒子翻转（SEU）的方法进行了研究，从单机层面提出了扩频应答机基带现场可编程门阵列（FPGA）和数字信号处理（DSP）抗SEU的方法，包括配置存储区回读校验、“看门狗”、三模冗余、动态刷新和程序区巡检等设计方法；从系统层面提出了由星上特定设备根据规定的原则对扩频应答机进行关机和开机操作的有效解除单粒子故障的方法。根据我国S频段非相干扩频应答机在轨飞行试验结果，单机发生SEU后自主恢复的概率超过99％，其余1％采用系统级的方法进行了恢复，验证了文章所述方法的有效性和正确性。