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利用随机扩增多态性DNA（RAPD）分子标记技术，分析了山核桃5个天然居群150个个体的遗传多样性和遗传结构，20条10bp的随机引物共扩增出252个位点，其中，多态性位点168个，多态位点百分率（PPB）为66．7％。居群水平Shannon’S多态性信息指数（I）在0．1992～0．2800间变化，物种水平，为0．4102；居群水平Nei’s基因多样性指数（H）介于0．1297～0．2051之间，物种水平H为0．2671。遗传变异计算显示，山核桃居群间基因分化系数（Gst）为0．3845。分子方差分析（