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为探讨环境因子对麒麟菜形态特征的影响，结合海洋环境因子对海南岛琼枝麒麟菜的形态特征进行了聚类分析。结果表明，随着水的深度的增加，温度、盐度、透明度、溶解氧逐渐增大，pH逐渐降低，流速逐渐减小，N、P、COD逐渐减小。琼枝麒麟菜在潮间带水越深的区域养殖越好，随着水深的增加，琼枝麒麟菜的颜色逐渐变红，分枝和齿数逐渐变多，卷曲程度逐渐变小。在水文物理环境、水环境化学方面，均是低潮区下部比低潮区上部好，对比形态特征得到的也是低潮区下部琼枝麒麟菜的颜色最深，分枝和齿数最多，而且卷曲度最小。