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目的：评价中药复方灌肠对肠道菌群的纠正作用。方法：选取2012年1月到2014年1月于我院就诊的肠道菌群感染患者共100例，将患者采用随机分组方法分为两组，每组各50例。对照组患者给与常规的临床分析和质量，观察组患者给予积极的中药复方灌肠治疗，每日一次，分别在接受治疗4周后，观察和比较两组患者的治疗效果。结果：观察组50例患者中，在接受中药复方灌肠治疗后，大肠杆菌菌落计数明显减少，且明显优于对照组，P＜0.05；观察组患者双歧杆菌、乳杆菌菌落计数明显增加，幅度大于对照组，P＜0.05。结论：中药复方灌肠治疗肠道菌群性疾病，能取得非常理想的治疗效果，能帮助调节患者体内的大肠杆菌，控制菌群失调等不良现象，稳定患者肠杆菌群，值得在临床上大力推广和应用。