目的:通过观察黄芪汤对二甲基亚硝胺(DMN)诱导的大鼠肝纤维化模型的效应,分析黄芪汤对肝纤维化组织的差异基因表达谱变化,探讨黄芪汤改善肝纤维化的分子机制。方法:采用DMN建立大鼠肝纤维化模型,并以黄芪汤治疗。用药4周后处死大鼠取肝组织,观察各组大鼠肝组织病理学变化,检测羟脯氨酸(Hyp)含量,提取肝组织总RNA,用全基因组芯片检测基因表达谱变化,并进行差异表达基因、本体论(GO)、信号通路分析,实时定量RT-PCR验证mRNA表达。结果:与正常组比较,模型组肝组织病理出现显著的肝损伤和肝纤维化,肝组织Hyp含量显著升高(P<0.01)。与模型组比较,黄芪汤用药组能显著改善肝组织病理,降低肝组织Hyp含量(P<0.01)。差异基因表达谱分析显示,黄芪汤组与模型组比较后差异表达基因数量为1 011个(P<0.05,|Fold change|>1.5),其中上调431个,下调580个;富集的GO功能共有116条,主要涉及细胞外基质、细胞黏附、脂质蛋白复合物等功能;差异表达基因富集的信号通路共有70条,主要涉及细胞外基质受体作用、细胞黏附分子、黏着斑、代谢途径等。实时定量RT-PCR验证的基因表达与基因芯片检测结果趋势一致。结论:黄芪汤通过多基因、多功能、多信号通路的调节,改善了DMN诱导的大鼠肝纤维化病变。