基于生物信息学挖掘糖尿病心肌病表达谱芯片

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【摘要】

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目的基于生物信息学技术挖掘糖尿病心肌病(DC)相关差异表达基因及其功能。方法应用生物信息学方法分析基因表达谱数据集GSE4547。结果挖掘原始芯片数据,筛选到79个差异表达基

【作者】

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石磊李万鹏安军钰刘怡吴鹏吴文宇曹云山黄晏

【机构】

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甘肃中医药大学研究生院,甘肃省人民医院心内二科,宁夏医科大学研究生院

【出处】

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中国医药导报

【发表日期】

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2019年24期

【关键词】

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糖尿病心肌病 GEO数据库差异表达基因基因芯片生物信息学技术 Diabetic cardiomyopathyGEO databaseDifferentia

【基金项目】

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甘肃省卫生行业科研计划项目(GSWSKY2016-02)

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目的基于生物信息学技术挖掘糖尿病心肌病(DC)相关差异表达基因及其功能。方法应用生物信息学方法分析基因表达谱数据集GSE4547。结果挖掘原始芯片数据,筛选到79个差异表达基因。基于基因本体论功能注释和相关通路分析,以及通过构建差异共表达基因蛋白质互作网络及模块分析后,最终获得Hk2、Col1a2、Col1a1、Col3a1、Slc2a1、Cpt1a、Slc2a4、Cd36、Ucp3、Pdk4 10个关键基因为链脲佐菌素诱导DC的关键基因。结论最终获得的10个关键基因可能成为未来治疗糖尿病心肌病的潜在治疗

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