【摘 要】
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【目的】目前杉木分子标记数量无法满足种质资源评价及分子标记辅助育种等相关研究需求,需要开发更多的杉木SSR标记十分重要。【方法】以陈山红心杉转录组测序数据为基础,进
【机 构】
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江西省林业科学院江西省植物生物技术重点实验室,厦门市江平生物基质技术股份有限公司,青原区白云山林场
【基金项目】
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江西省重点研发计划项目(20181ACF60011),江西省林业科技创新项目(201802),江西省林业科学院博士启动项目(2017521101),江西省林业科学院青年科技人才培养项目(2018521101)
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【目的】目前杉木分子标记数量无法满足种质资源评价及分子标记辅助育种等相关研究需求,需要开发更多的杉木SSR标记十分重要。【方法】以陈山红心杉转录组测序数据为基础,进行EST-SSR标记的检测和开发,并对陈山红心杉二代种子园进行遗传变异分析。【结果】转录组测序共获得99 122 394个reads片段,包含了14.87 Gb的序列数据。序列组装后,获得76 597个unigene,共计104.18 Mb数据,平均长983 bp。寻找到8 072个SSR位点,单核苷酸和三核苷酸是主要重复类型,分别占总数的66
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