弓形虫急性感染小鼠肺组织的转录组分析

来源 :中国人兽共患病学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：edwinshi97531

【摘要】

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目的本研究旨在了解弓形虫感染小鼠肺组织转录组的变化。方法取感染和未感染弓形虫的小鼠肺组织提取总RNA并制备cDNA文库,采用BGISEQ-500测序平台对文库进行高通量转录组测序

【作者】

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曹纹侨李锴喻云谭青青陆合张静

【机构】

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重庆医科大学分子医学与肿瘤研究中心,重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室

【出处】

：

中国人兽共患病学报

【发表日期】

：

2021年3期

【关键词】

：

刚地弓形虫肺关键驱动基因 RNA-SEQ Q-PCR Toxoplasma gondii lung key driver gene RNA-seq q-PC

【基金项目】

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重庆市科学技术委员会资助(No.cstc2015jcyjA10017),重庆市教委资助(No.KJ 1400210)

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目的本研究旨在了解弓形虫感染小鼠肺组织转录组的变化。方法取感染和未感染弓形虫的小鼠肺组织提取总RNA并制备cDNA文库,采用BGISEQ-500测序平台对文库进行高通量转录组测序。从测序结果中筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并随机筛选10个差异表达基因利用实时荧光定量PCR(quantitative real time PCR,q-PCR)对其表达量进行验证。对总的差异表达基因进行Gene Ontology(GO)富集分析、Kyoto Encyc

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