【摘 要】
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目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用价值。方法 回顾性分析71例重症肺炎患儿的临床资料,均进行m NGS检测及传统病原学检测(TPD)。比较m NGS与TPD病原体及细菌检测结果 ,并分析m NGS细菌检测阳性的影响因素及TPD细菌检测阳性的影响因素。结果 71例患儿经m NGS病原体检测阳性66例,阳性率为93.0%;TPD病原体检测阳性51例,阳性率为71
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目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用价值。方法 回顾性分析71例重症肺炎患儿的临床资料,均进行m NGS检测及传统病原学检测(TPD)。比较m NGS与TPD病原体及细菌检测结果 ,并分析m NGS细菌检测阳性的影响因素及TPD细菌检测阳性的影响因素。结果 71例患儿经m NGS病原体检测阳性66例,阳性率为93.0%;TPD病原体检测阳性51例,阳性率为71.8%。两者病原体检测结果一致性较差(Kappa=0.234), mNGS病原体检测阳性率显著高于TPD,差异具有统计学意义(P=0.001<0.05)。TPD细菌检测阳性率为38.0%(27/71),培养时间为(79.2±15.7)h;mNGS细菌检测阳性率为67.6%(48/71),检出时间为(54.0±16.9)h。两者细菌检测阳性率一致性较差(Kappa=0.299), mNGS细菌检测阳性率显著高于TPD,检出时间显著短于TPD,差异均有统计学意义(P<0.05)。71例患儿经mNGS细菌检测阳性48例(67.6%)作为mNGS阳性组,阴性23例(32.4%)作为mNGS阴性组;mNGS阳性组的月龄5.5(2.3, 18.8)个月显著小于阴性组的18.0(3.0,54.0)个月,白细胞计数(WBC)13.2(8.5, 18.6)×10~9/L、血小板计数(PLT)(466.2±258.7)×10~9/L显著高于m NGS阴性组的9.6(5.7, 13.8)×10~9/L、(295.7±192.1)×10~9/L,差异均有统计学意义(P<0.05);两组性别、血红蛋白(Hb)、乳酸脱氢酶(LDH)、降钙素原(PCT)、抗生素使用率、氧合指数、先天性心脏病发生率、机械通气率、PICU住院天数、治愈出院率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。71例患儿经TPD细菌检测阳性27例(38.0%)作为TPD阳性组,阴性44例(62.0%)作为TPD阴性组;TPD阳性组的抗生素使用率55.6%(15/27)显著低于TPD阴性组的81.8%(36/44), WBC13.5(10.8, 22.5)×10~9/L显著高于TPD阴性组的10.0(6.1, 14.6)×10~9/L,差异均有统计学意义(P<0.05);两组性别、月龄、Hb、PLT、LDH、PCT、氧合指数、先天性心脏病发生率、机械通气率、PICU住院天数、治愈出院率并比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 mNGS可显著提高重症肺炎病原体的检出率,对临床治疗有指导作用,且受抗生素使用的影响较小。
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