【摘 要】
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【目的】分析不同生长年限桔梗根部内生细菌种群结构及多样性,为深入理解植物—微生物互作和挖掘可培养细菌资源,建立功能细菌资源库提供理论支持。【方法】采用Illumina MiS
【机 构】
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重庆市中药研究院/重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心/中国中医科学院中药资源中心重庆分中心
【基金项目】
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国家中药材产业技术体系建设专项(CARS-21),重庆市现代山地特色高效农业技术体系建设专项(2019〔5〕号)
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【目的】分析不同生长年限桔梗根部内生细菌种群结构及多样性,为深入理解植物—微生物互作和挖掘可培养细菌资源,建立功能细菌资源库提供理论支持。【方法】采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对1~3年生桔梗根部内生细菌的16S rDNA V3~V4区进行PCR扩增,对PCR产物进行高通量测序。使用QIIME软件统计不同样本的群落丰富度(Chao1指数和ACE指数)及多样性(Shannon指数和Simpson指数),运用R软件计算各样本共有OTU数量,并通过Venn图呈现各样本共有和独有OTU数量。同时
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